PNA 簡介:
PNA(Peptide nucleic acid,肽核酸)是一種人工合成的類似于DNA,RNA的化學(xué)物質(zhì)。PNA的骨架是由重復(fù)的N-2-(氨乙基)-甘氨酸為單位,經(jīng)由肽鍵組合而成。堿基與骨架之間是以亞甲羧鍵相連(圖1)。與多肽相似的是,PNA也有N端和C端的差別。同時由于PNA沒有如DNA,RNA上的磷酸基團(tuán),因此PNA與DNA,RNA之間缺乏電性相斥的現(xiàn)象,使得兩者之間的結(jié)合強度大于DNA與DNA之間的結(jié)合。由于PNA既不屬于多肽,也不屬于核酸,因此,PNA不易被蛋白酶或核酸酶水解,無論在體內(nèi)還是在體外,PNA都相當(dāng)穩(wěn)定,同時,由于堿基之間配對特異性極強,熱穩(wěn)定性高;诖嗽,PNA可以作為各類探針,PCR
blockers/PNA Clamping,microRNA
inhibitor 等應(yīng)用于生物學(xué)研究以及醫(yī)學(xué)診斷中。
PNA 結(jié)構(gòu):
PNA特性&優(yōu)勢
強結(jié)合力:PNA是由電中性的酰胺骨架組成,因此PNA鏈與DNA鏈之間無排斥現(xiàn)象,因此,PNA與DNA之間具有更強的結(jié)合力。
強特異性及靈敏性:在不存在錯配的情況下,PNA/DNA結(jié)合穩(wěn)定性強于DNA/DNA;在錯配情況下,PNA/DNA結(jié)合穩(wěn)定性弱于DNA/DNA。即便是單個堿基錯配,也會造成溶解曲線的巨大差異。因此,可以區(qū)分單個堿基的錯配。沒出現(xiàn)1個堿基的錯配,Tm值平均降低15°C,如果2個堿基錯配,則完全不能雜交,因此特異性極高。
強穩(wěn)定性:PNA具有較強的化學(xué),生物學(xué),熱力學(xué)穩(wěn)定性。PNA在高溫,強PH條件下,均具有較強的穩(wěn)定性。并且由于PNA骨架有別于核酸以及多肽骨架,因此,核酸酶及蛋白酶均不易降解PNA。
強雜交穩(wěn)定性:PNA在高鹽濃度的雜交液中具有較強的穩(wěn)定性,以及結(jié)合力。因此,PNA可以作為比較穩(wěn)定的雜交探針應(yīng)用于科學(xué)研究。在相同條件下,15個相同序列的堿基,DNA/DNA的Tm值為53.3°C,DNA/RNA的Tm值為50.6°C,PNA/DNA的Tm值高達(dá)69.5°C,PNA/PNA更是高達(dá)72.3°C,即與相同序列的天然核酸堿基序列相比,每增加1個堿基,解鏈溫度提高1°C,大大提高了雜交穩(wěn)定性。
強安全性:PNA幾乎沒有毒性,為小鼠經(jīng)脈注射PNA,2h后觀察PNA存在于所有的組織器官中,而90%的PNA在用藥后24 h內(nèi)以未經(jīng)修飾的形式經(jīng)尿排出,因此PNA對于生物體來說,具有很高的安全性。